中国晶体学会是中国晶体学工作者自愿组成的、学术性、公益性社会团体，是中国科学技术协会的组成部分。 中国晶体学会是我国发展晶体科学技术的重要社会力量。
　　
　　中国晶体学会前身为国际晶体学联合会中国委员会，1978年以该名义加入国际晶体学联合会（International Union of Crystallography，IUCr）。 1984年唐有祺院士当选为该会第十三届执行委员，1987年又当选为该会第十四届副主席。1999～2005年中国科协书记张泽院士任执行委员会委员。学会于1986年在北京组织了首届小分子结构国际学术会议，1988年在天津组织了晶体学暑期国际训练班，1993年在北京成功举办了国际晶体学联合会第十六届学术大会与会员代表大会，加强了国际晶体学界对我国晶体学领域的了解，扩大了国际影响。 1993年3月30日经国家科委批准成立中国晶体学会，4月9日经中国科学技术协会致民政部准予登记，8月19日经民政部批准登记、注册，学会成立。首届理事长为唐有祺。会址设在北京大学。学会目前为第七届理事会，理事长为洪茂椿。历届理事长为：唐有祺、闵乃本、饶子和、林建华、高松、苏晓东。
　　
　　学会的领导机构为理事会。 理事会每4年改选1次，由全国会员代表选举产生。 现为第七届理事会，由98名理事组成，理事长为洪茂椿。目前在册会员2898人。 常务理事会下设生物大分子、小分子、粉末衍射、晶体生长与材料表征、电子显微学、药物晶体学、极端条件晶体材料、晶体应用与产业分会、小角散射、固体局域结构与全散射技术、陶瓷专业委员会（筹）等11个专业委员会和晶体学教育与普及工作委员会、青年工作委员会。监事会为第二届，由7名监事组成，监事长为陈建中。学会党委为第二届，由5名党委成员组成，书记为郭国聪，副书记为苏成勇、孙俊良。